En el año 2009, la FC puso en marcha el Programa de Becas Institucionales como resultado del estudio sobre becas con enfoque de equidad que realizaron para la Fundación el centro REDES (Argentina) y el de Información y Documentación Científica (CINDOC, España). El propósito del estudio fue establecer las bases conceptuales y metodológicas necesarias para asegurar que el Programa de Formación ofreciese becas con enfoque de equidad, aspirando así a contribuir al fortalecimiento de sectores prioritarios de América Latina y propiciando el retorno de los becarios para contribuir al desarrollo de la región.

El modelo de beca institucional se concibe como una ayuda para la financiación de planes de formación en algunas instituciones latinoamericanas de educación superior. Se trata de conceder becas anuales a docentes de una misma universidad o centro de investigación de América Latina, a fin de que estudien programas de una misma área de conocimiento, impartidos en una única universidad española. De esta manera, la institución latinoamericana genera masa crítica en un ámbito de interés estratégico para su país, contribuyendo a la creación de capital social y, por tanto, cumpliendo así el principio básico de equidad.

Estas becas contribuyen decididamente a la creación de capacidades y al aumento de la calidad de la oferta de formación en las instituciones de los países seleccionados, con el consiguiente fortalecimiento institucional.  

El procedimiento de puesta en marcha de un proyecto de beca institucional incluye las siguientes fases:

En primer lugar, la FC convoca a los Rectores de las Universidades del país seleccionado a la presentación de este nuevo tipo de becas, emplazándoles, de interesarles este nuevo modelo, a presentar un proyecto en este sentido, de vigencia cuatrienal y con cinco becas por año, con la siguiente información:

-         Área de conocimiento o especialidad de los profesores que propondrían como candidatos a las becas.

-         Procedimiento de convocatoria interna y proceso de preselección de candidatos

-         Categoría de los profesores a proponer como becarios y, en su caso, si incluirán a recién egresados que, una vez seleccionados, contratarán como docentes.

-         Método de fidelización que utilizarán para que los becarios regresen a su país, una vez terminados sus estudios en España.

En segundo lugar,  la FC constituye un comité de evaluación, cuya finalidad es seleccionar el proyecto ganador, que obtendrá las becas institucionales. A partir de este momento, la FC localiza en la oferta de postgrado española el máster más adecuado al proyecto seleccionado.

En tercer lugar, se acuerda la cofinanciación de las becas entre la Universidad de América Latina, la Universidad española de destino y la Fundación, detalles que se recogerán en el correspondiente convenio de cooperación. El 80% de la financiación se distribuye entre la universidad española y la Fundación Carolina, reservándose solamente el 20% de la misma a la universidad de América Latina.

Una vez definido el proyecto y las condiciones de las becas, se inicia el proceso de presentación y selección de candidatos. Primeramente, la universidad latinoamericana ganadora presenta a la Fundación Carolina las candidaturas que estime oportunas, que serán evaluadas por un comité de selección compuesto por representantes de la Universidad española donde los becarios cursarán sus estudios, por personal de la Fundación Carolina y por uno o dos expertos independientes. Los candidatos seleccionados son citados a una entrevista personal en la Embajada de España ubicada en la capital de su país de origen, en la que participan personal de FC, representantes de las oficinas técnicas de cooperación de nuestras representaciones diplomáticas, así como algunos de nuestros exbecarios.

En la convocatoria 2009 se puso en marcha la primera fase del proyecto piloto de estas becas institucionales, escogiéndose para ello dos países: Paraguay y República Dominicana.

Conscientes de la potencialidad que encierra este proyecto a la hora de aumentar el impacto de la cooperación española, en 2010 la FC otorgará dos o tres programas más de becas institucionales.